微生物限度檢查和無菌檢查則屬于安全性檢查的部分。安全性檢查是比有效性檢查的項目更加需要關注和嚴格制定的。

　　一體化微生物限度檢查儀操作要注意的事項：

　　操作環境不符合規定

　　按微生物限度檢查要求，無菌室應由無菌操作間和兩個緩沖間組成，操作間與緩沖間之間應有樣品傳遞箱，操作間和緩沖間的門不應直對，每個無菌室應有獨立的空氣凈化系統；環境潔凈度不應 低于10000級，其操作點或凈化工作臺的凈化級別應達到100級。 筆者曾發現，在凈化工作臺啟動的情況下，有3批同一樣品在驗證試驗中回收率重現性差，后經分析發現是凈化工作臺不合格造成 的。因此，應加強無菌室的清潔、維護和保養工作，定期檢測元菌操作臺及凈化工作臺的潔凈度，對不合格者應及時處理。

　　操作誤差

　　操作不熟練，實驗環節控制不嚴格，或實驗操作不夠嚴謹，均會給試驗結果帶來很大影響。如放供試液或菌液入皿時每1 mL未*放盡；所加菌液計數不；在驗證細菌、霉茵及酵母菌計數 方法時，樣品及菌液注皿后未立即傾注培養基，由于樣品的活性作用造成前面的平皿與后面的平皿的細菌誤差大。

　　因此，在操作中， 所取制備菌液的單位體積菌數比標準規定的要稍高些，以減少加在樣品中的菌液體積。應將0.4-0.6mL菌液加在平皿中部，避免其流動，然后立即加入培養基，有兩人操作，以減少皿與皿間的試驗菌數誤差。

　　培養基靈敏度下降

　　為了方便，很多單位在試驗中都使用干粉培養基，但干粉培養基極易吸潮，存放不當會出現凝塊，使凝固性變差，所以，要注意干粉培養基的貯存和保管。用電爐直火加熱熔化培養基或將剩余的 培養基冷藏后再熔化使用，均很容易破壞培養基中的營養成分，并直接影響菌回收率。